W pierwszej sekwencji filmu poznajemy kilkoro bohaterów, których losy podążą odrębnymi ścieżkami, lecz będą się od czasu do czasu zazębiać: pracująca w Paryżu aktorka Anne (Juliette Binoche) spaceruje z młodszym bratem swojego chłopaka Jeanem, który obraża żebrzącą Rumunkę Marię, rzucając jej drobne śmieci zamiast pieniędzy. Zauważa to stojący obok nauczyciel głuchoniemych dzieci Amadou, który wdaje się w kłótnię z Jeanem. Ta sytuacja uruchamia wielowątkową opowieść Hanekego, który układa w swoim filmie mozaikę o współczesnej Europie: kontynencie nierówności społecznych i problemów rasowych. „Kod nieznany” był pierwszym filmem reżysera nakręconym w języku francuskim.